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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agrobiologia; Embrapa Algodão; Embrapa Amapá; Embrapa Amazônia Ocidental; Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Gado de Corte; Embrapa Gado de Leite; Embrapa Meio Norte / UEP-Parnaíba; Embrapa Pantanal; Embrapa Rondônia; Embrapa Semiárido; Embrapa Soja; Embrapa Solos; Embrapa Uva e Vinho. MenosEmbrapa Agrobiologia; Embrapa Algodão; Embrapa Amapá; Embrapa Amazônia Ocidental; Embrapa Amazônia Oriental; Embrapa Gado de Corte; Embrapa Gado de Leite; Embrapa Meio Norte / UEP-Parnaíba; Embrapa Pantanal; Embrapa Rondônia... Mostrar Todas |
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Data corrente: |
04/06/2001 |
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Data da última atualização: |
20/11/2009 |
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Autoria: |
EMBRAPA. |
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Afiliação: |
EMBRAPA-ACS. |
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Título: |
Almanaque Embrapa: descobrindo a pesquisa agropecuária. |
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Ano de publicação: |
2001 |
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Fonte/Imprenta: |
Brasília, DF: Embrapa, Assessoria de Comunicação Social, 2001. |
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Páginas: |
64 p. |
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Idioma: |
Português |
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Palavras-Chave: |
Almanaque; Cartilha; Embrapa; História em quadrinhos; Literatura infanto juvenil; Literatura infanto-juvenil; Literatura juvenil; Pesquisa Agropecuária; Pesquisa Socual; Research agriculture. |
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Thesagro: |
Agricultura; Alimento; Pesquisa; Pesquisa Agrícola; Pesquisa Social. |
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Thesaurus Nal: |
literature. |
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Categoria do assunto: |
--
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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Marc: |
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Registro original: |
Embrapa Amazônia Oriental (CPATU) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
URL |
Voltar
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Registro Completo
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Biblioteca(s): |
Embrapa Agricultura Digital. |
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Data corrente: |
15/04/2010 |
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Data da última atualização: |
29/09/2016 |
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Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
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Circulação/Nível: |
B - 1 |
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Autoria: |
GOMIDE, J.; MELO-MINARDI, R.; SANTOS, M. A. dos; NESHICH, G.; MEIRA JUNIOR, W.; LOPES, J. C.; SANTORO, M. |
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Afiliação: |
JANAÍNA GOMIDE, UFMG; RAQUEL MELO-MINARDI, UFMG; MARCOS AUGUSTO DOS SANTOS, UFMG; GORAN NESHICH, CNPTIA; WAGNER MEIRA JUNIOR, UFMG; JÚLIO CÉSAR LOPES, UFMG; MARCELO SANTORO, UFMG. |
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Título: |
Using linear algebra for protein structural comparison and classification. |
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Ano de publicação: |
2009 |
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Fonte/Imprenta: |
Genetics and Molecular Biology, v. 32, n. 3, p. 645-651, 2009. |
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DOI: |
http://dx.doi.org/10.1590/S1415-47572009000300032 |
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Idioma: |
Inglês |
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Conteúdo: |
In this article, we describe a novel methodology to extract semantic characteristics from protein structures using linear algebra in order to compose structural signature vectors which may be used efficiently to compare and classify protein structures into fold families. These signatures are built from the pattern of hydrophobic intrachain interactions using Singular Value Decomposition (SVD) and Latent Semantic Indexing (LSI) techniques. Considering proteins as documents and contacts as terms, we have built a retrieval system which is able to find conserved contacts in samples of myoglobin fold family and to retrieve these proteins among proteins of varied folds with precision of up to 80%. The classifier is a web tool available at our laboratory website. Users can search for similar chains from a specific PDB, view and compare their contact maps and browse their structures using a JMol plug-in. |
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Palavras-Chave: |
Contact maps; Latent semantic indexing; Linear algebra; Protein classification; Singular value decomposition. |
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Thesagro: |
Biologia molecular. |
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Thesaurus NAL: |
Molecular biology. |
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Categoria do assunto: |
X Pesquisa, Tecnologia e Engenharia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/147910/1/AP-UsingLinearAlgebra-Gomide-2009.pdf
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Marc: |
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650 $aMolecular biology
650 $aBiologia molecular
653 $aContact maps
653 $aLatent semantic indexing
653 $aLinear algebra
653 $aProtein classification
653 $aSingular value decomposition
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700 1 $aSANTOS, M. A. dos
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700 1 $aMEIRA JUNIOR, W.
700 1 $aLOPES, J. C.
700 1 $aSANTORO, M.
773 $tGenetics and Molecular Biology$gv. 32, n. 3, p. 645-651, 2009.
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Registro original: |
Embrapa Agricultura Digital (CNPTIA) |
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